文昌殿供奉的正纖沒是文昌帝君。文昌帝君又稱梓潼帝君、文曲星、文星，為主宰功名、祿位之神。文昌帝君右邊奉的是孔子，為中國儒家的開創人，道教奉之為舉納“大成至圣先師”；左邊是朱熹，為宋代理學巨匠。
文昌祭奠始于宋元，到明清已成為重要的官祭活動。二月初三是文昌的圣誕，全國各豎滑地都要按朝廷的祭典，在各地舉行祭奠文昌的活動。其祭奠規格與孔子相反，在文昌祖庭，知縣擔任主祭官，縣衙官吏、鄉里學子、紳士、百姓都要到這里來參祭。

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